Administrasjonen består av daglig leder, administrativ koordinator, og prosjekt- og kvalitetskoordinator. Administrasjonen har kontorsted ved Landanlegget. Havbruksstasjonen er delt opp i fire ulike avdelinger; Landanlegget, Fiskehelselaboratoriet, RASforsk og Senter for marin akvakultur. Hver av våre fire avdelinger har avdelingsleder, teknisk driftsansvarlig og en stab av forsøksteknikere og teknikere.
Organisering
Eierskap
Havbruksstasjonen i Tromsø AS er et driftsselskap som eies av UiT Norges arktiske universitet og Nofima AS med en halvpart hver. Havbruksstasjonen sto ferdig 4. september 1990 og ble finansiert av Nærings- og fiskeridepartementet. Bygningsmassen eies i dag av Statsbygg.
Styret består av tre representanter fra hver av eierinstutisjonene og en representant for de ansatte.