Fiskehelselaboratoriet er spesielt tilpasset forskning på sykdommer hos fisk og arbeid med genmodifiserte organismer i gjennomstrømmings- eller resirkuleringsanlegg. Anlegget er godkjent av Mattilsynet for arbeid med alle sykdommer som er relevant i norsk fiskeoppdrett. Fiskehelselaboratoriet består av 4 smitteisolat med 49 kar i størrelsen 200– 4000 liter, samt 25 små enheter på 30 liter for hold av fisk i smitteforsøk. I tillegg finnes et fiskelager med 13 kar (300-2000 liter) for usmittet kontroll- eller backupfisk.
Alt vann som har vært i kontakt med smitte varmebehandles ved 81 °C i 19 minutter før det forlater forsøksavdelingen. Dette sikrer at alle smittestoffer tilintetgjøres. Fiskehelselaboratoriet har gode smittehygieniske rutiner og personell som er GCP-sertifisert.
Smittemodellene som benyttes er utviklet av forsøkshaverne selv, og kunder som ikke har egen smittemodell kan kjøpe denne tjenesten hos Nofima, som har meget velfungerende og utprøvde modeller.